El sistema de seguridad está compuesto por  válvulas de seccionamiento y  válvulas de seguridad. Con el objeto de proveer de un sistema de seguridad a cada tramo del sistema de transporte, Transoccidente dispone de válvulas de seccionamiento equipadas con actuadores neumáticos y/o electrónicos con cierre automático por alta y baja presión de gas y corte por velocidad de caída de presión, distribuidos a lo largo del sistema de transporte.  Adicionalmente, el gasoducto es  monitoreado en tiempo real a través del sistema Scada.

Transoccidente también tiene instaladas válvulas de seguridad en puntos estratégicos del sistema, como son la Estación de Recibo de Gas, Medición Cali y la estación Acopi que permiten manejar cualquier situación de sobrepresión del gasoducto, mediante venteo a la atmósfera del gas en exceso que se encuentre en el sistema. Cada una de las válvulas de seccionamiento del sistema de transporte cuenta con un cerramiento que protege la integridad física de las válvulas.