​La limpieza interna del gasoducto se realiza con una herramienta llamada raspatubo o "Marrano". Esta herramienta se envía desde una trampa de lanzamiento y es desplazada por el diferencial de presión a través del tramo sometido a limpieza, mientras limpia las paredes internas del tubo. Para esta labor se dispone de trampas de envío y de recibo ubicadas en la línea troncal del sistema de transporte, que también se pueden emplear para el envío y recibo de "marranos inteligentes" (Herramienta electrónica de inspección del estado de la tubería).

La limpieza de la tubería se realiza basado en el plan de mantenimiento de infraestructura de transporte de Transoccidente S.A. E.S.P., con base en los procedimientos internos documentados en el sistema de gestión de calidad de la empresa.